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一个基金项目完成后的经验教训总结

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thinker 发表于 2009-3-6 04:17:35 | 显示全部楼层 |阅读模式
一个基金项目完成后的经验教训总结

而今这个项目已经做完了,记下来感想的意思,是要吸取里面的经验和教训,并且给版上的朋友们,和大家一起讨论,希望自已和大家不要走类似的弯路。

2002年左右,当手头那个细菌基因组测序完成时,就开始动手做一个新的项目。

在当时,项目的总体思路还是很好的:打算先从细菌里把它的“神经系统”基因都预测出来(全基因组测序时,基因标注做不到那么细,当然值得详细分析),然后和近缘菌株做比较基因组和进化生物学分析,看看细菌的“神经系统”是如何进化和分化的。随后,用遗传突变的方法把这些基因全部突变,然后筛选表型改变,对个别感兴趣的基因做更深入的信号转导分析。这样做的话,可以把分子进化分析和遗传学分析很好地统一起来,做成一个既有理论预测,又有实验证明的,非常系统的研究。当年用这个思路顺利拿到了NNSF的基金资助。

现在这个研究已经按质按量完成。然而,包含全部预测、进化和实验分析数据打包后形成的一篇“系统长文”被比较好的综合类期刊拒了。最后只好把理论部分和实验部分拆开分别发表,其中理论部分(进化)发在本专业最好的期刊上,实验部分投出后还在审稿当中。虽然我们获得了大批可用于下一轮研究的实验材料和思路(基于这个研究的新的NNSF基金项目已立项开工),虽然在publication方面也有一定斩获,虽然这份研究一定可以在领域内有实质性的贡献(干这行的肯定得引用这些论文),但与原初的愿望相距还是比较远的(本想发篇“大”文章,呵呵,思想浮燥啊)。而今项目完成,深感其中有很多需要吸取的教训。

教训1:研究一定要做得快些,快些,再快些!

虽是02年构思的项目,但因为自已忙着上一个项目(我恨基因组学!累)也缺乏帮手,真正大规模开始是04年5月份的事。虽然我们紧赶慢赶在1年多一点的时间里(05年底)做完了所有的实验分析(工作量可不小啊,单Southern我就亲手做了150多次,被同位素照得烁烁发光),但正好06年碰到一堆子杂务,写大小本子花了近8个月的时间,还加上徒劳地找工作。8月开始补实验和数据合并处理,12月出初稿,07年4月投才出去。现在来看,这样搞是不行的。细菌基因组学是一个发展快得可怕(!!)的领域,同样思路的论文,虽然做的是别的细菌,已经发出来了。如果就按真正做事的时间,我们可以在04年就做完投出去的话……(好象不爽的人们都这样想,啊)

这个教训的一个推论是:当手里有一批完整的数据时,整理发出去!不要去想等第二批完整的数据出来后搞个“大”的。在一个竞争激烈的领域里,慢就是错。

教训2: 正向遗传学是科学探索,反向遗传学是科学工具

这个项目走的是典型的反向遗传学思路:先预测,后证明。然而现在自我感觉最为不爽的也就是这一点。反向遗传学一定是站在已知的知识上进行分析的,出发时就大概知道终点在哪儿。平心而论,创新意义一定是有限的。而正向遗传出来的数据和现象是你事先不可预知的,往往会拿到意外的数据,继而走出别人没走出的道路。这也让我更深一步地认识了生物学:这是一门基于现象的科学,现象永远是第一位的,而理论预测必须是第二位的。借用胡老先生的话,应该改为:“搜罗迷人的现象,再做大胆的假设,完了小心地求证”,切记切记。

以后再做时,一定走“有枣无枣打一杆再说”的研究思路!

教训3:在广和深这两个问题上,宁深勿广

这里,我受生态学和进化生物学研究的影响太大了(谁叫自已老家在这儿呢),总想着做“更系统”的分析,呵呵,活干了不少,结果吃力未讨好。短期内拿到的“系统”一定是肤浅的,在有限的研究时间限定下,应该立刻把研究目标聚焦在一个更有意义的问题上。所谓“系统”的研究,其实可以时间换空间,较“系统”的研究其实可以在较长的时间内做出来,不必也千万别想着一个项目就把它搞定。

推论是:在单位时间内,尽量研究深一些,而不是铺得更开一些。

经验4:进化分析后做出的进化研究,创新性和可持续性远不如遗传分析后做出的进化探索

这一点太过专业了(得看原始文献了,呵呵),其实我是在对几条项目研究得到的几条基本结论进行评价后有这个感想的。进化分析再好,无非告诉我哪个东西进化模式比较独特,快一点或慢一点什么的,想follow的话简直无从下口。然而,遗传分析给我的数据却让人眼前一亮,因为有一些有趣的发现直接指向了新的研究方向,其中必定包含着新的进化模式。并且更加重要的是,这样的分析同时也已准备好了我做下一步研究的实验材料!想都不必想立刻就可以接着干下去。

经验5:衡量你研究做得好的标准是什么?

当然,有很多朋友会说那自然是论文的IF喽。这自然是对的。不过我有一个更现实的想法:那就是做完研究后你发现必须杀进一个全新的领域里,掌握从来没想要掌握的新技术,新方法,才有可能继续你的全新思路,而不是甲醇换乙醇再搞一遍时,你的这个研究一定做得还过得去。原地踏步当然是研究者的大忌。

验6:嗯,无论如何,得有几条枪了,呵呵。我可打算要比中关村的平均年龄活多长一点,否则,那可真的成了“中官村”了......

先总结到这吧,有些想法我还要再酝酿酝酿哩。

当然,还包含一个更普遍的经验:

构思一个项目,一点点做下去,直到完成!

转自:中国生物论坛biooo
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