发表SCI论文，图片处理技巧要掌握！
科学论文中,图片占有重要的地位,可以说是论文是否被接受的关键之一。文字有点长，但请务必耐心看完……01
文章中的图片操作的三大原则
1)原始图像要保留,修改后的图像务必另存而不要覆盖原始图像;
2)尽量减少保存次数,以免损失图像质量,可以多处修改一一完毕后再做存盘;
3)所有操作不得使图像失真,任何影响图像真实性的修改都是不允许的。
02
拼图要求
不可能直接在原始图片上做上述修改,一般都要将若干张图片或图片的部分在一张画布上进行分布,需经过素材收集-拼合-标注等步骤,因此在这里称之为拼图。此步在获得原始图片之后进行,完成后再参照第一部分作修改。
标注:
标注的内容主要包括bar条、箭头等突出符号、编号等。
1)bar条
利用Photoshop作bar条,需要采集和原始照片同等放大倍数下的标尺照片。这可以通过在不同放大倍数的物镜下拍摄游标卡尺的标准刻度来做到,注意游标卡尺的厚度应与样品的厚度一致,可通过加垫片来解决。同时打开样品照片和标尺照片,在较大的比例缩放下,用矩形选框工具仔细选择一段标尺,将此框移到样品照片上,右键选择填充黑色,将此bar层移到合适的位置后合并图层。注意bar的放大缩小必须于图片同时等比例,否则将失去意义。时间bar一般由采样软件给出,在此就不讨论了。
2)箭头
Photoshop中绘制箭头可能较其它一些专业的图像分析软件烦琐一些。在左手边的快捷键面板上选择 自定义形状工具(有的显示为 直线工具,按扭右下角扩展三角中可改变),菜单栏下的工具定义栏中 形状:下拉框中可选择三种不同形状的箭头,选中后在图片窗口中拖动就可画出箭头。不过这三种箭头的形状不是惯常的形状。最常用的三角、燕尾、平脚箭头可以用另一方法画出:点选 直线工具,点右边的下拉小三角出现箭头参数选单,勾选箭头位置(不勾则划直线),宽度、长度、凹度分别为500%、500%、0时可画出三角;500%、1000%、25可画出燕尾;500%、1000%、0可画出平角。画出的箭头都分别占一层,可各自移动到合适位置,要删除也可用删除层的方法,排列合适后拼合图层。箭头用来突出显示需要读者注意的地方,也可用其它方式,如加框等,这些都可以用Photoshop方便的完成,这里就不赘述了。
3)编号
利用左手边的快捷键面板上的“文字工具”可以方便的添加文字及字母,点扩展三角还可以选择横排文字还是竖排。建议英文字体选择 Arial,较Times New Roman更清晰。编号、坐标值等文字信息可以放到修改图片大小及分辨率之后做,可避免文字变得不清晰,也可防止有时单调长或宽而使文字变瘦长或矮胖。添加的文字也单独成层,最后注意拼合图层。
01
关于原始图像的获取
任何修改工作都是在原始图像的基础上进行,如果原始图像质量不佳,那必将事倍功半。下面对有利于原始图像质量的细节略做介绍。因为不同来源的图像,其注意点也不一样,因此分开。
1)来自照相的获得的数码文件多是在显微镜视野下采集的,因此聚焦和暴光是必须要考虑的。显微镜下景深极浅,意味着聚焦清晰不能依赖于小光圈,而应靠精细调节显微镜。注意应使照相通道和目镜观察通道相一致,即目镜下最清晰时也是拍照最清晰的,以方便拍照。拍照时相机应选择最大光圈,广角端。不要使用望远变焦,它使得视野变小且放大倍数难以计算。聚焦不清的另一主要问题在于相机的抖动。虽然一般相机都固定在显微镜上,但按快门时的手震有时仍不可忽视,这时一个简单的办法是利用相机的自拍功能,按下快门之后经倒数计时后正式拍摄。一般明视野下,利用相机的自动暴光都能达到要求;暗视野下有时需要高达几分钟的暴光时间,这是一般数码相机达不到的,只能通过专业的CCD系统并用软件帮助采集图像。一些软件可以用来修改暴光不足的照片,但暴光过度往往使图像细节丢失。显微镜下拍摄时闪光灯不起作用,将它关闭。通过白平衡,一般不会产生严重的偏色。另外,由于镜头的原因,边角处难免会有失真,因此,请保证目标在视野正中,镜头成像最佳范围内,而无须铺满整个视野,现在的数码相机的像素值已经足够高了。
2)来自采样软件的采样软件所采得的原始图形一般储存在特定格式的文件中,通过该软件或配套的分析软件打开。有的采样或分析软件可以将图形直接输出到word或Photoshop中,但有的则不能。这时最简单的办法就是通过抓屏或抓图软件来获取。通过采样软件获取的图形输出后仅做些切割、拼合的工作,不应该做更多其它的修改。图形在采样软件中可以通过改变x:y轴的缩放比改变形状,因此一组图片应该选择统一的标准,并且标注x:y标尺。图形的精细程度和采样频率相关,采样频率越高,图片越精细。图片中不必要的颜色信息可以在Photoshop中丢弃,图像/调整/去色。
3)来自统计作图软件的 常用的统计作图软件包括origin、sigma plot等,功能非常强大,但一般应用excel也可满足。这些软件作的图一般都可直接输出到word及Photoshop中(如excel,选中图片,右键复制,打开Photoshop,新建,自动跳出匹配的画布大小,编辑/粘贴 即可),所以修改图片应多在统计软件中,输出后不宜多做修改。图中尽量不要用颜色或灰度来区别组间,而多利用形状特征。如excel的柱状图,选择“填充/图案”,里面有足够多的选择项。各统计作图软件功能强大,超出了本文叙述的范围,就不多说了。
杂志社对投稿图片的分辨率通常有如下要求:TIFF: Colour or greyscale photographs (halftones): always use a minimum of 300 dpi.
TIFF: Bitmapped line drawings: use a minimum of 1000 dpi.
第一点说的是灰度图的dpi在至少300dpi以上,比如病理图片、电泳图等;
第二点说的是点阵线性图的分辨率一般在1000dpi以上,比如用excel所作曲线或柱状图,chemdraw所画结构式等。投稿所遇到的问题:通常数码照片的dpi为72而excel所作图片的dpi为200均不能满足投稿需求,因此要更改dpi 设置解决方法:在photoshop新建一个 A4格式的图片,在图片大小选项中将分辨率选为杂志所需的分辨率(比如1000ppi,这里可能又涉及到一个ppi和dpi的概念,其实你不用多管,简单说来,一个相当于电脑屏幕的输出(ppi),一个相当于打印机的输出(dpi),你只要ppi设为1000,打印的分辨率就为1000dpi,两者在数值上是等量的)。将excel或照片直接粘贴到新建图层中(注意,这是的图片显示的可能会很小),将图片放大到适合观看的大小,剪切所需区域,如果杂志社对图片大小有要求可以通过图片大小选项设定(例5cm*3cm),保存为tiff格式,将保存layer前的对钩去掉,确定,采用LZW压缩,确定,即可。这样保存的图片大约为200k.dpi增大的优点:通常我们用excel作的图贴到word或直接保存为图片,会发现,图片缩小会比较清初,但是放大后遍模糊
将 dpi增大后,虽然缩小图片感觉不如直接保存清初,但是你放大很多倍后图像仍清晰。
如果原图是用“Origin”做的曲线图,按照要求“1200 dpi (dots per inch) for black and white line art (simple bar graphs, charts, etc.)”的要求修改过程如下:(1)将所做的图用程序“Origin” (如OriginPro 7.5)打开;(2)点击菜单”File” “Export Page..” 在“保存类型”中选“Tag Image File(*.tif)”,同时在 “Show Image Options”前打勾 , 确定“保存”;(3)在TIFF Options窗口中,“DIP” 设为1200;“Color Depth” 选Monochrome;“Compression” 选LZW,最后点击“OK”即可。(4)将所得的TIF格式图片用Photoshop打开,在菜单“图像”, “图像大小”中确认 “分辨率”为1200象素/英寸,将“宽度”设定为6000像素左右;点击“好”。(5)“文件”, “存储为”,“格式”选为“TIFF”,“保存”;在“图像压缩”中选“LZW”; 点击“OK”;就可获得满足杂志要求的图片了!
如果图片是JPG等照片,如电镜照片等,300 dpi for halftones (black and white photographs)600 dpi for combination halftones (photographs that also contain line art such as labeling or thin lines)按照上面的任一个要求,处理如下:
(1)图片用Photoshop打开,在菜单“图像”中的 “图像模式”中选择“灰度”(用于黑白图片)或者“CMYK”(用于彩色图片)
(2)在“图像”中的“图像大小”设定“分辨率”为600(或300)象素/英寸,将“宽度”设定为3000像素左右;点击“好”。
(3)“文件”-“存储为”-“格式”选为“TIFF”-“保存”;在“图像压缩”中选“LZW”; 点击“好”;就可获得满足杂志要求的图片了。
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