找回密码
 注册

QQ登录

只需一步,快速开始

楼主: sunnie-yang

[求助]PubMed是什么意思啊?

[复制链接]
fanping 发表于 2005-9-22 16:02:00 | 显示全部楼层
 

PUBMED简单检索技巧>>

>>

         在地址栏内键入http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/ 或是http://www.PubMed.gov/后,就进入了PUBMED检索系统主页。>>

在靠近页面上部的地方,首先映入我们眼帘的,即是供我们输入所需查询内容的检索框。 >>

         在检索框中输入查询词,然后单击"go"按钮或按回车键,PubMed将会自动开始检索,并将检索到的相关条目显示在屏幕上。在检索框前面,你还可以选定所要检索内容的数据库范围,除NCBI的数据库以外,可供选择的还有:PROTEIN, STRUCTURE, POPSET等等。>>

   在这里提供以下建议仅供读者参考:

l     明确你索要检索的关键概念及词语,即关键字;

l     考虑到关键字的类似说法,即有可能出现的同义词;

l     通过限定DATES, STUDY GROUP等,精炼你的检索范围;

l     多向有经验的人求教,因为不同专业背景以及个人差异,都有可能形成不同的方法和技巧。

l     通过布尔(BOOLEAN)运算来提高你的效率

    最常用的三种布尔运算即是AND,OR,NOT

    1AND提供的运算方式即不管所输入的两个关键词语所出现的位置在哪,只要他们都出现在索引文章的某一处,就将其列出。

    2)而OR则是将出现至少一个关键词的文章列出,这种运算在想将相似主题的文章罗列在一起时,十分有效。

  3 NOT运算可以在你的检索范围内将某些不需要的部分除去。但是在使用的时候要特别注意,会有可能将一些你所需要的文章漏掉。比如当你的检索词为LEAD POISONING NOT CHILDREN时,除了会删除掉那些仅讨论儿童的文章,同时也会删去那些同时讨论儿童及其他年龄组的文章。

fanping 发表于 2005-9-22 16:05:00 | 显示全部楼层
 

PUBMED高级检索技巧>>

 

    为了使得检索更为准确,高效,可以充分利用PubMed所提供的高级检索功能。在进入PubMed首页之后,在检索框的下方,有PubMed所提供的五个重要的功能按钮,即Limits按钮, Preview/Index按钮, History按钮, Clipboard按钮,Details按钮。>>

   1. Limits 按钮>>

当你单击Limits按钮后可以进行以下设定:>>

n          将搜索范围设定在一个特定的域。>>

n          将搜索范围设定在特定的年龄组、性别组、人类或动物学范围。

n          也可以将搜索限定在某一语种出版的或某一特定的文章类型(如综述)。

n          设定只搜索包含摘要的文献。

n          设定搜索Entrez数据库或Publication数据库。

n          设定搜索范围为PubMed数据库的某一子数据库(如Abridged Index Medicus AIDS相关的条目)。

    例如 All Fields域选择下拉菜单里,你可以把搜索词限定在一个特定的域,缺省设置是所有的域;打开下拉菜单就可以选择所需的域名了。又如"Only items with abstracts"指只检索那些有文摘的记录(1975年前出版的文章的记录中没有文摘)

    2Preview/Index 按钮

    在按下Preview/Index按钮之后,可以进行的设定有:

n          在显示条目之前显示所查到的文献数。

n          随时通过增加查询单词来修改查询方案。

n          在特定的搜索域中向方案里加入查询词。

n          Index中查看并选择词语来修改查询方案。

    在你修改查询时查看方案。

    Preview(预览) 使用此功能可以在显示条目之前显示所查到的文献数。使用时,在输入框中键入搜索词,然后单击PreviewPubMed返回的信息是条目的数量。

    Index(索引) 使用此功能,可以从特定域中选择以索引的单词,并把他们加入查询方案之中;可以查看某一个特定搜索域中词语列表;也可以使用布尔运算符来建立一个查询方案。

    3History 按钮

    History (历史记录)历史记录中保存的是你所有的查询方案与查询结果,只有当你运行了一次查询之后,History中才有内容。History屏幕将会显示:你的查询方案、查询时间、查询到的文献数量。Preview显示的是历史记录中最近的三条记录,而使用History可以看到最近100次的查询结果。一旦查询数量超过100PubMed会将最早的查询除去,加进最新的一次查询。如果两次查询内容相同,PubMed会将头一次的去除。

    4Clipboard 按钮

    剪贴板可以帮助你保存或查看在一个或多个查询中选择的条目,然后就可以打印、保存、订购剪切板中的内容了。将条目左边的复选框选中,单击"Add to clipboard"就可以将其加入剪切板中。当点击 Clear History可以将History中的所有内容清除。

    剪切板中最大的储存数是500条。而放在剪切板中的内容如果在一小时内没有任何操作,将会自动消失。

    5Details  按钮

    Details是用于帮助你查看PubMed的检索策略。即在提问框中键入的检索词被PubMed自动地转换成了那些词,并使用了什么样的检索规则和检索语法。此外,使用Details键可以对检索策略进行编辑,然后再一次检索。在PubMed Query框内显示的是PubMed实际使用的检索策略和语法。该框下有四个区域:Result区显示检索结果的记录总数,点击这个数字,可回到检索结果显示屏;Translation区显示检索词转换的详细情况;Database区显示检索的数据库;User Query 区显示用户键入的检索词或检索式。

    要对检索策略进行编辑可直接点击PubMed Query框中的检索策略,将其增加、删除或修改后点击Search键。

    除了以上五个主要功能键以外,利用PubMed提供的其他一些功能,如MeSH 等,也可以在很大一部分程度上提高我们的检索效率。

fanping 发表于 2005-9-22 16:06:00 | 显示全部楼层
 

PUBMED检索类型

 

>>

通常我们所要查询的单词类型大致可以分为:>>

u        词语(主题)检索 这时我们在PubMed主页的检索框中键入的是英文单词或短语(大写或小写均可)。然后回车或点击"Go" PubMed即使用其词汇自动转换功能进行检索,并将检索结果直接显示在主页下方。例如:键入"vitamin c common cold"后回车或点击"Go" PubMed开始检索并将检索结果显示出来。>>

u        著者检索 当我们所要查询的是著作者时, 在检索框中键入著者姓氏全称和名字的首字母缩写,格式为:"著者姓 空格 名字首字母缩写",例如smith ja,然后回车或点击Go,系统会自动到著者字段去检索,并显示检索结果。>>

u        刊名检索 在检索框中键入刊名全称或MEDLINE形式的简称、ISSN号,例如:molecular biology of the cell, mol biol cell, 1059-1524,然后回车或点击Go,系统将在刊名字段检索,并显示检索结果。>>

u        日期或日期范围检索 可以在检索框中键入日期或日期范围,然后回车或点击Go,系统会按日期段检索,并将符合条件的记录予以显示。日期的录入格式为YYYY/MM/DD;如:1999/09/08 ;也可以不录月份和日子,如:20001999/12

u        检索期刊子集(辑) 检索的格式为:检索词AND jsubseta,如:neoplasm AND jsubseta。可供检索的期刊子库有3种:Abridged Index Medicus(120种重要核心期刊)DentalNursing。分别使用jsubseta, jsubsetd, jsubsetn进行限定。

u        检索带文摘的记录 检索的格式为:检索词AND has abstract, 如:liver cancer AND has abstract。要注意的是在1975年前出版的文章,其MEDLINE记录中没有文摘。

u        布尔逻辑检索 PubMed系统允许使用布尔逻辑检索,只要在检索框中键入布尔逻辑运算符(ANDORNOT)。具体使用时要注意的问题,详见上第3点所述。

fanping 发表于 2005-9-22 16:07:00 | 显示全部楼层
 

如何处理检索结果

 

 

    当你点击GO或回车后,PubMed将会自动运行检索命令,在屏幕的下方显示出符合检索要求的项目,并且在查询框内保留原检索词。此时要注意的是符合检索要求的项目是以SUMMARY(简要格式)显示出来的,就是列出作者,文章题目,以及文章来源的一些信息。>>

     DISPLAY键后还可以选择别的显示格式,点击DISPLAY键后,系统按所选格式全部检索结果。>>

     如果只需要显示其中一部分记录,则需点击该记录左边的查询框,使标记后,再点击Display键;如果只需显示一条记录,则可直接点击该记录中的作者姓名超链接,系统会自动显示该记录的文摘格式。>>

     还有一点,系统所设定的默认值为每页显示20条选项,这点可以在SHOW后的下拉菜单处选择。>>

     如果选中所感兴趣的内容,即可进行保存,打印等等操作。PubMed系统允许最多可保存5000条记录。要保存全部检索结果时,打开Summary下拉菜单选择其中一种格式,然后点击Save键;要保存特定记录时,点击记录左边的选择框予以标记后,再点击Save键。>>

使用浏览器的打印功能,即可把感兴趣的内容打印出来。系统允许每页最多显示500条记录。如果想打印成文本格式,请先点击Text键,然后再打印。

fanping 发表于 2005-9-22 16:09:00 | 显示全部楼层
 

PUBMED检索小技巧

 

pubmed是我们最常用到的检索数据库,功能非常强大,但在实际应用过程中往往有一些非常实用的功能不被重视,下面就我的使用经验谈谈体会,请高手指正并补遗。>>

>>

1、   History功能>>

作为PUBMED的“四大金刚”之一,至少有50%的人忽略了它的好处。当你检索的主题词有很多的别名、定义或缩写时,或者你要检索多个领域交叉的文章时,如果单单在检索框里输入检索词和逻辑运算符,将显得非常累赘、容易出错并且不易查全、查准。这时你可以试试HISTORY功能:每次检索时只要输入最简单的检索式,然后进入HISTORY,这时你就发现刚才你所有的检索结果都在里面,而且还编上了号,接下来不用说了,你就可以随心所欲地排列组合你的检索词了,如:#1 AND2 2 OR3 NOT4,等等,就象在Medline中检索一样方便。(注意:HISTORY中输入检索式后按回车的效果与按PREVIEW按钮是一样的,即仅显示检索结果有多少篇,但按GO按钮之后就会跳出HISTORY进入题名或文摘界面,再进HISTORY时就需切换一下,有点麻烦)>>

2、   CUBBY功能>>

使用CUBBY功能(在PUBMED界面的左边有CUBBY的链接)可以保存你的检索式。如果需要跟踪某一领域的最新进展,可以将检索式保存在CUBBY中,定期调用查看一下就能紧跟潮流了。 CUBBY功能需要注册,不过是完全免费的。

3、   高效利用PUBMED

在实验过程中常常会为引物设计、退火温度、蛋白质大小等等的实际问题所困扰,回顾文献往往效率很低,查不到很具体的东西,这时用PUBMED,把你所要找的东西直接敲进去,如Primer, RT-PCR, Western Blot,等等,总而言之就是把PUBMED当作GOOGLE来用好了,由于PUBMED收录的文章关键词给得很全,很多,所以十步之内必有芳草,可能连你预期的实验结果图例都有了。

4、   Journal DataBase

PUBMED不光提供了许多全文链接,而且其JournalDatabase功能也很有用。当你看到一篇参考文献而不知道期刊全名时,用Journal DataBase搜一下就可以了,然后把全名往GOOGLE里一贴,就可以找到这本期刊的网站了。Journal DataBase另一个重要功能是提供网上全文期刊目录,对于哪本杂志被哪些数据库收录、收录了哪几年的都有详细的说明。由于数据库之间存在交叉收录现象,所以知道这些信息是非常有用的。比如,要找circulation的一篇文章,但手头没有密码,查看期刊目录,发现circulationovid收录了,而学校恰好订了ovid,于是搞定。还有一些比较偏的杂志,在网上没有自已的站点,但有可能被一些常见的数据库如ProquestEbsco等收录,知道这些情报之后就可以有的放矢了。

您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册

本版积分规则

Archiver|手机版|小黑屋|生物行[生物导航网] ( 沪ICP备05001519号 )

GMT+8, 2025-6-29 16:04 , Processed in 0.037348 second(s), 13 queries .

Powered by Discuz! X3.5

© 2001-2025 Discuz! Team.

快速回复 返回顶部 返回列表