[转贴]核酸数据库

核酸数据库

DNA和蛋白质相互作用数据库  
这是DNA和蛋白质相互作用数据库的网站。根据意想中的多个目的，有关的数据正在收集中。比如对大肠杆菌DNA结合蛋白已证实位点与非位点进行编目，为其他大肠杆菌数据库及序列条目提供注解，解释在整个基因组中体内甲基...

http://arep.med.harvard.edu/dpinteract/ 详细资料

四氢生物蝶呤  
这是四氢生物蝶呤的网站，在该网站上，有关于BH4的国际数据库，BH4缺陷及其引起变异的国际数据库，BH4缺陷的一般知识，监测方法和双亲组织等，蝶呤的结构和生物合成以及苏黎世的研究组织、参考实验室、会议等和发表?..

http://www.bh4.org/ 详细资料

NCBI分类学主页  
此网页是美国生物技术国立研究中心的分类学数据库。此库收录的物种超过55,000种。任何物种在GenBank中对应的核酸和蛋白质序列至少一条。此界面是一个分类学浏览器目录，用户可通过目录直接进入浏览资源。

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/ 详细资料

原核生物核糖体RNA操纵子拷贝变异数据库  
原核生物核糖体RNA操纵子拷贝变异数据库（rrndb）提供与原核生物基因组中rRNA操纵子的拷贝数的相关信息。现在数据库已包括467个条目，可以通过物种属名，种名及亚种名，以及系统发生群等术语和作者，文章标题，时间?..

http://rrndb.cme.msu.edu/rrndb/servlet/controller 详细资料

人类特定转录物数据库  
人类特定转录物数据库HUNT是由经过序列分析和结构分析后注释的人类全长cDNA序列。所有的cDNA克隆是Helix研究所利用寡核苷酸图谱法和部分序列分析评估得出的。网站同时提供启动子鉴定，模体分析和重叠群组装等分析工?..

http://www.hri.co.jp/HUNT 详细资料

生物信息学：数据库  
生物信息学：数据库刊录了2001和2002核酸研究新的和更新的数据库一览表。此页面提供数十个数据库的链接，包括十分闻名的GenBank, DBCAT, EMBL, DDBJ, COG, MIPS, PIR, SWISS-PROT等。

http://compbiology.org/?section=bio-db 详细资料

CARBBANK和CCSD  
CCSD是一个包含复和糖类结构和相关文本的数据库。这些信息主要来自科学的出版物和提交物。CARBBANK是一个允许使用CCSD数据库文件信息的计算机软件。它有一个编辑器，可产生数据库记录和寻找作者、结构、组成、分支数...

http://bssv01.lancs.ac.uk/gig/pages/gag/carbbank.htm 详细资料

蛋白质和DNA识别数据库  
蛋白质和DNA识别数据库和工具是一个帮助研究者了解核酸和蛋白质识别机制的系统。这个数据库由蛋白质核酸复合物数据库（蛋白质核酸复合物的结构数据汇集）、碱基氨基酸相互作用数据库（碱基氨基酸相互作用结构信息）?..

http://www.rtc.riken.go.jp/jouhou/3dinsight/recognition.html 详细资料

蛋白质核酸复合物数据库  
蛋白质核酸复合物数据库是一个包含蛋白质核酸复合物结构数据的数据库。这些数据按照复合物中蛋白质的识别模体和DNA形式分类。搜索界面使用户通过关键词、识别模体、DNA形式等搜索数据库，并且搜索结果直接和3DinSigh...

http://www.rtc.riken.go.jp/jouhou/3dinsight/complexdb.html 详细资料

AA索引  
AA索引是氨基酸索引数据库。它包含20种氨基酸的各种物理、化学和生物学参数的数值，以及序列联配用的各种置换矩阵，例如PAM和BLOSSUM矩阵等。网页上还有参考、应用、检索和下载信息等。

http://www.genome.ad.jp/dbget/aaindex.html 详细资料