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华大基因研究中心主办,英国Sanger研究所协办的首届“生物信息学技术方法及实例应用”短期培训班将于2006年3月 17-20日举行! 培训班邀请国内外顶尖生物信息学家介绍生物信息学的最新研究热点及最新进展,结合在权威期刊上发表的文章进行相关领域研究方法的实例分析,并将介绍基因组学和生物信息学的实用基本技术和分析方法(配合大型机上机实习辅导)。对任何背景的生物信息学科研工作者和准备投身于这一领域的学生,都是个极为难得和颇有价值的学习机会! 培训方向与热点: 培训课程设计覆盖各学科背景(生物、医学、计算机、数理等)欲从事生物信息学研究或应用生物信息学方法解决本领域问题的科研工作者。 整个课程将涉及基因组总体分析、基因识别、序列功能注释(重复序列、调控区、coding-基因、各类RNA)、基因表达(包括基因芯片、EST、SAGE等)、蛋白组、多态性分析、分子进化和比较基因组等领域的内容,并从基本原理、具体案例、分析方法、适用工具及使用流程等方面深入浅出的介绍应用生物信息学方法解决各个领域问题的全套过程。 具体课程安排: 3月17日-3月18日,基本概念和工具介绍。简要介绍生物信息学各个研究方向的基本原理和发展情况,并由具有丰富经验的一线科研工作者介绍41种生物信息学实用分析软件的详细使用方法,普及生物信息学分析所需的基本概念和工具。(软件列表) 3月19日,案例分析,开拓思路。由来自英国剑桥Sanger研究院及丹麦、美国等国际顶尖的学者和国内一流的生物信息学家讲述应用生物信息学方法进行项目分析的经典案例,包括Ensembl、Pfam、ACEDB等知名数据库和软件的构建;水稻、家鸡、嗜热菌等典型基因组的测序分析;重测序、基因分型等后期分析方法的使用实例;解决医学问题的具体案例等。 3月20日,上机实习。在大型计算机环境下,亲手操作介绍的各种分析软件,并由专人指导,完成具体案例,灵活使用适合于各种问题的分析方法。 培训班讲师资料: 特邀外籍教师: Richard Durbin 英国Sanger研究所 Sanger研究所副所长、生物信息部主管;早期人类基因组计划的主要成员。“Genome Research”、“Genome Biology”、“BMC Bioinformatics”编委会成员、英国BioBank科学委员会成员及数据管理小组主席、人类基因组委员会成员、计算生物学国际协会成员、英国皇家统计协会成员,《生物序列分析(Biological Sequence Analysis)》一书作者。
Avril Coghlan 英国Sanger研究所 都柏林三一学院遗传学博士,在“PNAS”,“PloS Biology”,“Genome Research”等杂志发表论文多篇。 Jean-Karim Hériché 英国Sanger研究所 高级计算生物学研究员,法国约瑟夫-傅立叶大学博士,在“Science”,“Oncogene”,“JBC”等杂志发表论文多篇。 Lachlan James Murray Coin 英国Sanger研究所 Sanger研究院博士,在“PNAS”,“Nature Review Cancer”,“Nuclear Acid Research”杂志上发表文章多篇。 Lars Bolund丹麦Aarhus大学 教授,丹麦医学研究理事会成员、丹麦伦理理事会成员、丹麦技术评估委员会成员、丹麦癌症协会成员、丹麦医学和自然科学学会成员。在细胞生物学及临床遗传学的基因组/基因结构及功能研究,复杂疾病的细胞学分子机理,体细胞基因疗法领域发表文章240余篇。 Karsten Kristiansen 南丹麦大学 教授,原生物化学和分子生物学部主任、Odense研究基金、Fuhrmann研究基金理事会会员、丹麦农业科学研究院学术顾问、丹麦TCM学术顾问、印度Bangalore生物信息学中心学术顾问。 中方教师: Gane Ka-Shu Wong 华大基因研究中心/美国华盛顿大学 副主任,人类基因组计划参与者,籼稻、家蚕、家猪基因组计划、家鸡多态性图谱的主要参与者、负责人之一。其研究领域涉及到基因组组分分析、注释、表达、复制、比较基因组学、分子进化、转录调控、多态性等多个领域; 在“Nature”,“Science”,“Nature Genetics”,“Nature Review Genetics”,“Genome Research”等顶尖杂志发表多篇论文。 王俊 华大基因研究中心 研究员,生物信息部主管;人类基因组计划中国部分数据分析处理主要负责人。中国籼稻、家蚕、家猪基因组计划、家鸡多态性图谱计划生物信息学分析部分主要负责人。以第一作者或通讯作者发表的“Nature”、“Science”这一级别文章为五篇。同时涉及到的包括组装、比对、注释在内的软件算法及数据库文章多篇发表在“PLoS Computational Biology”,“Genome Research”,“Nucleic Acids Research”等。 李松岗 北京大学 教授,早期研究生态系统的计算机模拟,近年来从事生物信息学研究工作,曾参与水稻基因组测序、拼接、信息学分析等项目。目前受聘于中国科学院北京基因组研究所/北京华大基因研究中心。 郑伟谋 中国科学院理论物理研究所 研究员 中国科学院理论物理所教授。主要从事理论生物物理 (Theoretical Bio-Physics, TBP)、非线性科学 (Nonlinear Sciences, NS)、统计物理 (Statistical Physics, SP)等方面的研究。在水稻基因图谱的绘制中,为基因注释作出了重要贡献。 高扬 华大基因研究中心 核酸部 副主管 李恒 华大基因研究中心 比较基因组研究组 组长 李瑞强 华大基因研究中心 基因多态性研究组 组长 倪培相 华大基因研究中心 基因组装及组分分析研究组 组长 方林 华大基因研究中心 基因识别与注释研究组 组长 郑洪坤 华大基因研究中心 分子进化研究组 组长 陈晨 华大基因研究中心 基因表达研究组 组长 培训班收费及报名:详细资料点击进入 报名联系人: 赵孟瑶 010-80481511 zhaomengyao@genomics.org.cn 张蕴赜 010-80481163 zhangyz@genomics.org.cn 在线报名 |