测序流程及模板要求 基本测序过程: 测序接收的样品主要有四类:菌液、质粒、已纯化PCR和PCR原液。 实验室收到样品后,首先对客户填写的定单进行确认和补充。(客户姓名、单位地址、邮箱、电话、样品编号、引物编号、反应数)然后根据不同的样品类型对样品进行分类编号。 1. 测序前处理 菌 样:将当天收取的菌样进行接种培养,过夜培养后用试剂盒进行质粒提取(免费服务项目,对于低拷贝质粒收取一定费用)。将提出的质粒跑琼脂糖胶鉴定质粒浓 度,达到规定浓度的质粒交下一组实验,未达到规定浓度的质粒和未摇出菌的样品,作好记录后重新摇菌并提取质粒,对于两次未能提出质粒或不能摇出菌的样品, 不再重复实验,E-MAIL给客户,建议客户重新挑取新的克隆样品后测序。 PCR原液:将PCR原液上样于纯化胶后电泳检测,对浓度较高的样品进行切胶用胶回收试剂盒回收,去除PCR引物、酶和其他杂质。然后电泳检测样品浓度,达到规定浓度的PCR样品交下一组实验。浓度不高的样品将停止实验,(注:电泳后有多条带和有弥散带的样品也将停止实验,因为这样的样品通常不能得到好的测序结果)。 质粒和PCR已纯化样品:将质粒和PCR已纯化样品直接电泳检测浓度,对于不能达到规定浓度的样品将停止实验。达到规定浓度的样品交下一组实验。 2.测序反应 将处理好的DNA模板经鉴定确定浓度,做PCR测序反应,PCR反应结束后经过一系列的纯化过程将酶、荧光染料、引物和其他离子去除。 3.上测序仪电泳 4.测序结果分析 测序仪将自动分析电泳样品的DNA序列。分析人员对测序结果再次进行分析校对,数据分析完毕将结果通过Email发送给相应的客户。如果客户的测序结果有问题,我们将对结果进行分析并提出解决建议。 测序样品要求。 1. PCR原液 片段通常大于200bp,小于1000bp。 提供浓度大于50ug/ul,体积大于50ul。 2ul电泳检测条带清晰,无非特异性杂带。 2. PCR已纯化 割胶回收特异性单一条带,PCR纯化后产物溶于超纯水中。 OD260/280在1.8~2.0之间,不含RNA、蛋白、基因组DNA、EDTA。 浓度大于50 ug/ul,体积大于20ul。 纯化后产物电泳检测条带单一。 3. 质粒要求 质粒溶解在灭菌水中,浓度大于100 ng/ul,体积大于20ul。 OD260/280在1.8~2.0之间,不含RNA、蛋白、基因组DNA、EDTA。 1%琼脂糖凝胶检测质粒条带清晰,无条带压缩、拖带。 对于低拷贝质粒请直接提供1ug纯化质粒。 建议使用相关试剂盒提取。 建议同时提供1ml菌液。 大质粒需要注明载体长度。 4. 菌液模板要求 说明载体的抗性,我们提供Amp、kan、chl。 提供1 ml左右的过夜培养的新鲜菌液,加15%灭菌甘油,于离心管中封口保存,防止交叉污染或泄漏。 建议尽量提供穿刺培养的菌种。 5. 引物要求 测序引物经PAGE纯化,长度20个碱基左右。 浓度大于5pmol/ul,体积大于20ul。 随机引物和兼并引物不适合测序。 尽可能提供引物全序列,PCR退火温度。 订单上注明的通用引物我们免费提供。 6,价格:30元/反应(15个反应或以上)35元/个(15个反应以下) 免费提供通用测序引物 详情请联系上海瑞基生物科技有限公司 Tel:021-64858434;13917974072 王晴 Email:info@realgene.com.cn Http://www.realgene.com.cn
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